Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BNIP3LO60238 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms