Protein–RNA interactions for Protein: O00237

RNF103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF103O00237 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF103O00237 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF103O00237 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF103O00237 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF103O00237 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF103O00237 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF103O00237 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF103O00237 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF103O00237 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF103O00237 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF103O00237 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF103O00237 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF103O00237 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF103O00237 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF103O00237 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF103O00237 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF103O00237 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF103O00237 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF103O00237 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF103O00237 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF103O00237 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF103O00237 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF103O00237 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF103O00237 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF103O00237 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF103O00237 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF103O00237 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF103O00237 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF103O00237 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF103O00237 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RNF103O00237 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RNF103O00237 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF103O00237 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF103O00237 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF103O00237 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF103O00237 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF103O00237 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF103O00237 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF103O00237 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF103O00237 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF103O00237 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF103O00237 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF103O00237 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF103O00237 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF103O00237 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF103O00237 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF103O00237 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF103O00237 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF103O00237 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF103O00237 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF103O00237 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF103O00237 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF103O00237 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF103O00237 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF103O00237 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF103O00237 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF103O00237 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF103O00237 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF103O00237 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF103O00237 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF103O00237 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF103O00237 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF103O00237 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF103O00237 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF103O00237 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF103O00237 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF103O00237 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF103O00237 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF103O00237 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF103O00237 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF103O00237 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF103O00237 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF103O00237 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF103O00237 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF103O00237 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF103O00237 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF103O00237 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF103O00237 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF103O00237 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF103O00237 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF103O00237 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF103O00237 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF103O00237 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF103O00237 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF103O00237 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF103O00237 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF103O00237 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF103O00237 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF103O00237 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF103O00237 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF103O00237 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF103O00237 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF103O00237 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF103O00237 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF103O00237 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF103O00237 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF103O00237 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF103O00237 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF103O00237 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF103O00237 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms