Protein–RNA interactions for Protein: F5H4B4

FAM227A, Protein FAM227A, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227AF5H4B4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM227AF5H4B4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM227AF5H4B4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM227AF5H4B4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM227AF5H4B4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM227AF5H4B4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM227AF5H4B4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM227AF5H4B4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM227AF5H4B4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM227AF5H4B4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM227AF5H4B4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM227AF5H4B4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM227AF5H4B4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM227AF5H4B4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM227AF5H4B4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM227AF5H4B4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM227AF5H4B4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM227AF5H4B4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM227AF5H4B4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM227AF5H4B4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM227AF5H4B4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM227AF5H4B4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM227AF5H4B4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM227AF5H4B4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM227AF5H4B4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM227AF5H4B4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM227AF5H4B4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM227AF5H4B4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM227AF5H4B4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM227AF5H4B4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM227AF5H4B4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM227AF5H4B4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM227AF5H4B4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM227AF5H4B4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM227AF5H4B4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM227AF5H4B4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM227AF5H4B4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM227AF5H4B4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM227AF5H4B4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM227AF5H4B4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM227AF5H4B4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM227AF5H4B4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM227AF5H4B4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM227AF5H4B4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM227AF5H4B4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms