Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA6L9A6NEM1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA6L9A6NEM1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA6L9A6NEM1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA6L9A6NEM1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GOLGA6L9A6NEM1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GOLGA6L9A6NEM1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GOLGA6L9A6NEM1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GOLGA6L9A6NEM1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GOLGA6L9A6NEM1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6L9A6NEM1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6L9A6NEM1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6L9A6NEM1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6L9A6NEM1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6L9A6NEM1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6L9A6NEM1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA6L9A6NEM1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA6L9A6NEM1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA6L9A6NEM1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA6L9A6NEM1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA6L9A6NEM1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA6L9A6NEM1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA6L9A6NEM1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA6L9A6NEM1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA6L9A6NEM1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA6L9A6NEM1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA6L9A6NEM1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA6L9A6NEM1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA6L9A6NEM1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA6L9A6NEM1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA6L9A6NEM1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA6L9A6NEM1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA6L9A6NEM1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA6L9A6NEM1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6L9A6NEM1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6L9A6NEM1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6L9A6NEM1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA6L9A6NEM1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA6L9A6NEM1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA6L9A6NEM1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA6L9A6NEM1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA6L9A6NEM1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA6L9A6NEM1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA6L9A6NEM1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA6L9A6NEM1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GOLGA6L9A6NEM1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GOLGA6L9A6NEM1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms