Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQU0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQU0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A1W2PQU0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A1W2PQU0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
A0A1W2PQU0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A1W2PQU0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A1W2PQU0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A1W2PQU0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A1W2PQU0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A1W2PQU0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A1W2PQU0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A1W2PQU0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A1W2PQU0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A1W2PQU0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A1W2PQU0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A1W2PQU0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A1W2PQU0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A1W2PQU0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A1W2PQU0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A1W2PQU0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A1W2PQU0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A1W2PQU0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A1W2PQU0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A1W2PQU0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A1W2PQU0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A1W2PQU0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A1W2PQU0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A1W2PQU0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A1W2PQU0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A1W2PQU0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A1W2PQU0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A1W2PQU0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A1W2PQU0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A1W2PQU0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A1W2PQU0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A1W2PQU0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A1W2PQU0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A1W2PQU0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A1W2PQU0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A1W2PQU0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A1W2PQU0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A1W2PQU0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A1W2PQU0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A1W2PQU0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A1W2PQU0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
A0A1W2PQU0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
A0A1W2PQU0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
A0A1W2PQU0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A1W2PQU0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms