Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2H6

FNDC3A, Fibronectin type-III domain-containing protein 3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC3AQ9Y2H6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNDC3AQ9Y2H6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNDC3AQ9Y2H6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNDC3AQ9Y2H6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNDC3AQ9Y2H6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNDC3AQ9Y2H6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNDC3AQ9Y2H6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNDC3AQ9Y2H6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FNDC3AQ9Y2H6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FNDC3AQ9Y2H6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FNDC3AQ9Y2H6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FNDC3AQ9Y2H6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FNDC3AQ9Y2H6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FNDC3AQ9Y2H6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FNDC3AQ9Y2H6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FNDC3AQ9Y2H6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FNDC3AQ9Y2H6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FNDC3AQ9Y2H6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FNDC3AQ9Y2H6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNDC3AQ9Y2H6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNDC3AQ9Y2H6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNDC3AQ9Y2H6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNDC3AQ9Y2H6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNDC3AQ9Y2H6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNDC3AQ9Y2H6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNDC3AQ9Y2H6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNDC3AQ9Y2H6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNDC3AQ9Y2H6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FNDC3AQ9Y2H6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNDC3AQ9Y2H6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNDC3AQ9Y2H6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNDC3AQ9Y2H6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNDC3AQ9Y2H6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNDC3AQ9Y2H6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FNDC3AQ9Y2H6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNDC3AQ9Y2H6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNDC3AQ9Y2H6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNDC3AQ9Y2H6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FNDC3AQ9Y2H6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNDC3AQ9Y2H6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC3AQ9Y2H6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC3AQ9Y2H6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC3AQ9Y2H6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC3AQ9Y2H6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC3AQ9Y2H6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC3AQ9Y2H6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC3AQ9Y2H6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC3AQ9Y2H6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FNDC3AQ9Y2H6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FNDC3AQ9Y2H6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FNDC3AQ9Y2H6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FNDC3AQ9Y2H6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FNDC3AQ9Y2H6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FNDC3AQ9Y2H6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FNDC3AQ9Y2H6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FNDC3AQ9Y2H6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FNDC3AQ9Y2H6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FNDC3AQ9Y2H6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FNDC3AQ9Y2H6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FNDC3AQ9Y2H6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FNDC3AQ9Y2H6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FNDC3AQ9Y2H6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FNDC3AQ9Y2H6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FNDC3AQ9Y2H6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC3AQ9Y2H6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC3AQ9Y2H6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC3AQ9Y2H6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC3AQ9Y2H6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC3AQ9Y2H6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC3AQ9Y2H6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC3AQ9Y2H6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNDC3AQ9Y2H6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNDC3AQ9Y2H6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNDC3AQ9Y2H6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNDC3AQ9Y2H6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FNDC3AQ9Y2H6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNDC3AQ9Y2H6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNDC3AQ9Y2H6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNDC3AQ9Y2H6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNDC3AQ9Y2H6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNDC3AQ9Y2H6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNDC3AQ9Y2H6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNDC3AQ9Y2H6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNDC3AQ9Y2H6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNDC3AQ9Y2H6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNDC3AQ9Y2H6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNDC3AQ9Y2H6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNDC3AQ9Y2H6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FNDC3AQ9Y2H6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FNDC3AQ9Y2H6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FNDC3AQ9Y2H6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FNDC3AQ9Y2H6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC3AQ9Y2H6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC3AQ9Y2H6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC3AQ9Y2H6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FNDC3AQ9Y2H6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FNDC3AQ9Y2H6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms