Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU0

ACSL6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL6Q9UKU0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSL6Q9UKU0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSL6Q9UKU0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSL6Q9UKU0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSL6Q9UKU0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSL6Q9UKU0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSL6Q9UKU0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSL6Q9UKU0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSL6Q9UKU0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSL6Q9UKU0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSL6Q9UKU0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSL6Q9UKU0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSL6Q9UKU0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSL6Q9UKU0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSL6Q9UKU0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSL6Q9UKU0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSL6Q9UKU0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSL6Q9UKU0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSL6Q9UKU0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACSL6Q9UKU0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.2 ms