Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYTH4Q9UIA0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYTH4Q9UIA0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYTH4Q9UIA0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYTH4Q9UIA0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYTH4Q9UIA0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYTH4Q9UIA0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYTH4Q9UIA0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYTH4Q9UIA0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYTH4Q9UIA0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYTH4Q9UIA0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYTH4Q9UIA0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CYTH4Q9UIA0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYTH4Q9UIA0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYTH4Q9UIA0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYTH4Q9UIA0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYTH4Q9UIA0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYTH4Q9UIA0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYTH4Q9UIA0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYTH4Q9UIA0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYTH4Q9UIA0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYTH4Q9UIA0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYTH4Q9UIA0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYTH4Q9UIA0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYTH4Q9UIA0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYTH4Q9UIA0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYTH4Q9UIA0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYTH4Q9UIA0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYTH4Q9UIA0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYTH4Q9UIA0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYTH4Q9UIA0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CYTH4Q9UIA0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYTH4Q9UIA0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYTH4Q9UIA0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYTH4Q9UIA0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYTH4Q9UIA0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYTH4Q9UIA0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYTH4Q9UIA0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYTH4Q9UIA0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYTH4Q9UIA0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYTH4Q9UIA0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYTH4Q9UIA0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYTH4Q9UIA0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYTH4Q9UIA0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYTH4Q9UIA0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYTH4Q9UIA0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYTH4Q9UIA0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CYTH4Q9UIA0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYTH4Q9UIA0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYTH4Q9UIA0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYTH4Q9UIA0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYTH4Q9UIA0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYTH4Q9UIA0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYTH4Q9UIA0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYTH4Q9UIA0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYTH4Q9UIA0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYTH4Q9UIA0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYTH4Q9UIA0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYTH4Q9UIA0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CYTH4Q9UIA0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYTH4Q9UIA0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYTH4Q9UIA0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYTH4Q9UIA0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYTH4Q9UIA0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CYTH4Q9UIA0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYTH4Q9UIA0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CYTH4Q9UIA0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYTH4Q9UIA0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYTH4Q9UIA0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYTH4Q9UIA0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYTH4Q9UIA0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYTH4Q9UIA0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYTH4Q9UIA0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYTH4Q9UIA0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYTH4Q9UIA0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYTH4Q9UIA0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYTH4Q9UIA0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYTH4Q9UIA0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYTH4Q9UIA0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYTH4Q9UIA0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CYTH4Q9UIA0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms