Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
XCL2Q9UBD3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
XCL2Q9UBD3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.8 ms