Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DCLK3Q9C098 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCLK3Q9C098 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCLK3Q9C098 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCLK3Q9C098 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCLK3Q9C098 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DCLK3Q9C098 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCLK3Q9C098 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCLK3Q9C098 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCLK3Q9C098 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DCLK3Q9C098 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DCLK3Q9C098 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DCLK3Q9C098 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DCLK3Q9C098 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DCLK3Q9C098 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DCLK3Q9C098 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DCLK3Q9C098 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DCLK3Q9C098 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DCLK3Q9C098 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DCLK3Q9C098 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DCLK3Q9C098 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DCLK3Q9C098 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DCLK3Q9C098 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DCLK3Q9C098 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DCLK3Q9C098 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DCLK3Q9C098 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DCLK3Q9C098 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DCLK3Q9C098 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DCLK3Q9C098 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DCLK3Q9C098 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DCLK3Q9C098 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DCLK3Q9C098 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DCLK3Q9C098 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DCLK3Q9C098 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DCLK3Q9C098 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DCLK3Q9C098 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DCLK3Q9C098 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DCLK3Q9C098 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DCLK3Q9C098 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DCLK3Q9C098 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DCLK3Q9C098 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DCLK3Q9C098 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DCLK3Q9C098 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DCLK3Q9C098 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DCLK3Q9C098 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DCLK3Q9C098 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DCLK3Q9C098 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DCLK3Q9C098 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DCLK3Q9C098 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DCLK3Q9C098 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DCLK3Q9C098 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DCLK3Q9C098 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
DCLK3Q9C098 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DCLK3Q9C098 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DCLK3Q9C098 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DCLK3Q9C098 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DCLK3Q9C098 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DCLK3Q9C098 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DCLK3Q9C098 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DCLK3Q9C098 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DCLK3Q9C098 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DCLK3Q9C098 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DCLK3Q9C098 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DCLK3Q9C098 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DCLK3Q9C098 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DCLK3Q9C098 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DCLK3Q9C098 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DCLK3Q9C098 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DCLK3Q9C098 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DCLK3Q9C098 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DCLK3Q9C098 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DCLK3Q9C098 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DCLK3Q9C098 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DCLK3Q9C098 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DCLK3Q9C098 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DCLK3Q9C098 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DCLK3Q9C098 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DCLK3Q9C098 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DCLK3Q9C098 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DCLK3Q9C098 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DCLK3Q9C098 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DCLK3Q9C098 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DCLK3Q9C098 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DCLK3Q9C098 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DCLK3Q9C098 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DCLK3Q9C098 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DCLK3Q9C098 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DCLK3Q9C098 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DCLK3Q9C098 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DCLK3Q9C098 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DCLK3Q9C098 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DCLK3Q9C098 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DCLK3Q9C098 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCLK3Q9C098 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCLK3Q9C098 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCLK3Q9C098 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCLK3Q9C098 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCLK3Q9C098 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DCLK3Q9C098 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCLK3Q9C098 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms