Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CHMP4AQ9BY43 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CHMP4AQ9BY43 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CHMP4AQ9BY43 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.49
CHMP4AQ9BY43 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CHMP4AQ9BY43 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CHMP4AQ9BY43 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CHMP4AQ9BY43 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CHMP4AQ9BY43 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CHMP4AQ9BY43 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CHMP4AQ9BY43 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CHMP4AQ9BY43 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CHMP4AQ9BY43 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CHMP4AQ9BY43 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CHMP4AQ9BY43 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CHMP4AQ9BY43 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHMP4AQ9BY43 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHMP4AQ9BY43 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
CHMP4AQ9BY43 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHMP4AQ9BY43 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHMP4AQ9BY43 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHMP4AQ9BY43 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHMP4AQ9BY43 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
CHMP4AQ9BY43 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CHMP4AQ9BY43 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CHMP4AQ9BY43 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
CHMP4AQ9BY43 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CHMP4AQ9BY43 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CHMP4AQ9BY43 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CHMP4AQ9BY43 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CHMP4AQ9BY43 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHMP4AQ9BY43 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHMP4AQ9BY43 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHMP4AQ9BY43 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHMP4AQ9BY43 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
CHMP4AQ9BY43 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHMP4AQ9BY43 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHMP4AQ9BY43 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHMP4AQ9BY43 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHMP4AQ9BY43 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHMP4AQ9BY43 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHMP4AQ9BY43 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHMP4AQ9BY43 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CHMP4AQ9BY43 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CHMP4AQ9BY43 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
CHMP4AQ9BY43 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CHMP4AQ9BY43 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHMP4AQ9BY43 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHMP4AQ9BY43 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHMP4AQ9BY43 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHMP4AQ9BY43 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHMP4AQ9BY43 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHMP4AQ9BY43 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHMP4AQ9BY43 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHMP4AQ9BY43 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHMP4AQ9BY43 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHMP4AQ9BY43 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
CHMP4AQ9BY43 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHMP4AQ9BY43 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CHMP4AQ9BY43 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CHMP4AQ9BY43 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CHMP4AQ9BY43 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CHMP4AQ9BY43 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CHMP4AQ9BY43 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CHMP4AQ9BY43 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CHMP4AQ9BY43 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CHMP4AQ9BY43 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CHMP4AQ9BY43 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CHMP4AQ9BY43 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CHMP4AQ9BY43 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CHMP4AQ9BY43 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CHMP4AQ9BY43 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CHMP4AQ9BY43 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CHMP4AQ9BY43 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CHMP4AQ9BY43 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CHMP4AQ9BY43 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
CHMP4AQ9BY43 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CHMP4AQ9BY43 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CHMP4AQ9BY43 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CHMP4AQ9BY43 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CHMP4AQ9BY43 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CHMP4AQ9BY43 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
CHMP4AQ9BY43 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CHMP4AQ9BY43 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CHMP4AQ9BY43 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CHMP4AQ9BY43 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CHMP4AQ9BY43 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
CHMP4AQ9BY43 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CHMP4AQ9BY43 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
CHMP4AQ9BY43 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CHMP4AQ9BY43 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CHMP4AQ9BY43 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CHMP4AQ9BY43 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CHMP4AQ9BY43 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CHMP4AQ9BY43 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CHMP4AQ9BY43 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CHMP4AQ9BY43 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CHMP4AQ9BY43 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CHMP4AQ9BY43 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CHMP4AQ9BY43 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms