Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS31

ZNF649, Zinc finger protein 649, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF649Q9BS31 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ZNF649Q9BS31 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF649Q9BS31 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms