Protein–RNA interactions for Protein: Q96RR1

TWNK, Twinkle protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWNKQ96RR1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TWNKQ96RR1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TWNKQ96RR1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TWNKQ96RR1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TWNKQ96RR1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TWNKQ96RR1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TWNKQ96RR1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TWNKQ96RR1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TWNKQ96RR1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TWNKQ96RR1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TWNKQ96RR1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TWNKQ96RR1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TWNKQ96RR1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TWNKQ96RR1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TWNKQ96RR1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TWNKQ96RR1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TWNKQ96RR1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TWNKQ96RR1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TWNKQ96RR1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TWNKQ96RR1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TWNKQ96RR1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TWNKQ96RR1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TWNKQ96RR1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms