Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FAM227BQ96M60 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FAM227BQ96M60 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FAM227BQ96M60 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FAM227BQ96M60 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FAM227BQ96M60 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FAM227BQ96M60 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FAM227BQ96M60 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FAM227BQ96M60 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FAM227BQ96M60 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FAM227BQ96M60 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FAM227BQ96M60 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FAM227BQ96M60 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FAM227BQ96M60 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FAM227BQ96M60 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FAM227BQ96M60 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FAM227BQ96M60 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FAM227BQ96M60 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
FAM227BQ96M60 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FAM227BQ96M60 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FAM227BQ96M60 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FAM227BQ96M60 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FAM227BQ96M60 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FAM227BQ96M60 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FAM227BQ96M60 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FAM227BQ96M60 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FAM227BQ96M60 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FAM227BQ96M60 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FAM227BQ96M60 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FAM227BQ96M60 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FAM227BQ96M60 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FAM227BQ96M60 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FAM227BQ96M60 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FAM227BQ96M60 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FAM227BQ96M60 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FAM227BQ96M60 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FAM227BQ96M60 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FAM227BQ96M60 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FAM227BQ96M60 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FAM227BQ96M60 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FAM227BQ96M60 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FAM227BQ96M60 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
FAM227BQ96M60 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
FAM227BQ96M60 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FAM227BQ96M60 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FAM227BQ96M60 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
FAM227BQ96M60 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
FAM227BQ96M60 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FAM227BQ96M60 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FAM227BQ96M60 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FAM227BQ96M60 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
FAM227BQ96M60 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FAM227BQ96M60 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FAM227BQ96M60 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FAM227BQ96M60 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FAM227BQ96M60 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FAM227BQ96M60 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FAM227BQ96M60 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FAM227BQ96M60 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FAM227BQ96M60 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FAM227BQ96M60 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FAM227BQ96M60 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FAM227BQ96M60 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FAM227BQ96M60 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FAM227BQ96M60 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FAM227BQ96M60 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FAM227BQ96M60 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FAM227BQ96M60 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FAM227BQ96M60 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
FAM227BQ96M60 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FAM227BQ96M60 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FAM227BQ96M60 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FAM227BQ96M60 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FAM227BQ96M60 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FAM227BQ96M60 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms