Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRELD1Q96HD1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRELD1Q96HD1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRELD1Q96HD1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRELD1Q96HD1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRELD1Q96HD1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRELD1Q96HD1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRELD1Q96HD1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRELD1Q96HD1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRELD1Q96HD1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRELD1Q96HD1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRELD1Q96HD1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CRELD1Q96HD1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CRELD1Q96HD1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRELD1Q96HD1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRELD1Q96HD1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRELD1Q96HD1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRELD1Q96HD1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CRELD1Q96HD1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRELD1Q96HD1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRELD1Q96HD1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRELD1Q96HD1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRELD1Q96HD1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRELD1Q96HD1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRELD1Q96HD1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRELD1Q96HD1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRELD1Q96HD1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRELD1Q96HD1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRELD1Q96HD1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRELD1Q96HD1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRELD1Q96HD1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRELD1Q96HD1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CRELD1Q96HD1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CRELD1Q96HD1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CRELD1Q96HD1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRELD1Q96HD1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRELD1Q96HD1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRELD1Q96HD1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CRELD1Q96HD1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms