Protein–RNA interactions for Protein: Q96FF7

MISP3, Uncharacterized protein MISP3, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MISP3Q96FF7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MISP3Q96FF7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MISP3Q96FF7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MISP3Q96FF7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MISP3Q96FF7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MISP3Q96FF7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MISP3Q96FF7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MISP3Q96FF7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MISP3Q96FF7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MISP3Q96FF7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MISP3Q96FF7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MISP3Q96FF7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MISP3Q96FF7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MISP3Q96FF7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MISP3Q96FF7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MISP3Q96FF7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MISP3Q96FF7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MISP3Q96FF7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MISP3Q96FF7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MISP3Q96FF7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MISP3Q96FF7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MISP3Q96FF7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MISP3Q96FF7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MISP3Q96FF7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MISP3Q96FF7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MISP3Q96FF7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MISP3Q96FF7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MISP3Q96FF7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MISP3Q96FF7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
MISP3Q96FF7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MISP3Q96FF7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MISP3Q96FF7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
MISP3Q96FF7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MISP3Q96FF7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MISP3Q96FF7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MISP3Q96FF7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MISP3Q96FF7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MISP3Q96FF7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MISP3Q96FF7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MISP3Q96FF7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MISP3Q96FF7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MISP3Q96FF7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MISP3Q96FF7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MISP3Q96FF7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MISP3Q96FF7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MISP3Q96FF7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MISP3Q96FF7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms