Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP0

RNF31, E3 ubiquitin-protein ligase RNF31, humanhuman

Predictions only

Length 1,072 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF31Q96EP0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF31Q96EP0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF31Q96EP0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF31Q96EP0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF31Q96EP0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF31Q96EP0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF31Q96EP0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF31Q96EP0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF31Q96EP0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF31Q96EP0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF31Q96EP0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF31Q96EP0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF31Q96EP0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF31Q96EP0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF31Q96EP0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF31Q96EP0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF31Q96EP0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF31Q96EP0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF31Q96EP0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF31Q96EP0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF31Q96EP0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF31Q96EP0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF31Q96EP0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF31Q96EP0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF31Q96EP0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF31Q96EP0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF31Q96EP0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF31Q96EP0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF31Q96EP0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF31Q96EP0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF31Q96EP0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF31Q96EP0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF31Q96EP0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF31Q96EP0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF31Q96EP0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF31Q96EP0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF31Q96EP0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RNF31Q96EP0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF31Q96EP0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF31Q96EP0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF31Q96EP0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms