Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
TRIM41Q8WV44 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
TRIM41Q8WV44 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
TRIM41Q8WV44 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
TRIM41Q8WV44 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC41.22■■■■■ 4.19
TRIM41Q8WV44 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
TRIM41Q8WV44 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.22■■■■■ 4.19
TRIM41Q8WV44 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC41.21■■■■■ 4.19
TRIM41Q8WV44 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
TRIM41Q8WV44 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.2■■■■■ 4.19
TRIM41Q8WV44 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
TRIM41Q8WV44 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
TRIM41Q8WV44 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
TRIM41Q8WV44 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
TRIM41Q8WV44 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC41.19■■■■■ 4.18
TRIM41Q8WV44 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
TRIM41Q8WV44 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
TRIM41Q8WV44 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
TRIM41Q8WV44 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
TRIM41Q8WV44 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
TRIM41Q8WV44 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
TRIM41Q8WV44 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
TRIM41Q8WV44 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
TRIM41Q8WV44 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
TRIM41Q8WV44 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
TRIM41Q8WV44 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
TRIM41Q8WV44 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC41.17■■■■■ 4.18
TRIM41Q8WV44 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
TRIM41Q8WV44 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
TRIM41Q8WV44 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
TRIM41Q8WV44 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
TRIM41Q8WV44 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
TRIM41Q8WV44 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
TRIM41Q8WV44 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
TRIM41Q8WV44 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
TRIM41Q8WV44 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
TRIM41Q8WV44 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
TRIM41Q8WV44 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
TRIM41Q8WV44 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
TRIM41Q8WV44 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
TRIM41Q8WV44 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
TRIM41Q8WV44 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
TRIM41Q8WV44 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
TRIM41Q8WV44 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
TRIM41Q8WV44 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
TRIM41Q8WV44 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
TRIM41Q8WV44 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC41.12■■■■■ 4.17
TRIM41Q8WV44 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC41.12■■■■■ 4.17
TRIM41Q8WV44 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
TRIM41Q8WV44 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
TRIM41Q8WV44 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
TRIM41Q8WV44 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
TRIM41Q8WV44 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
TRIM41Q8WV44 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
TRIM41Q8WV44 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
TRIM41Q8WV44 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
TRIM41Q8WV44 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
TRIM41Q8WV44 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
TRIM41Q8WV44 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
TRIM41Q8WV44 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
TRIM41Q8WV44 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC41.08■■■■■ 4.17
TRIM41Q8WV44 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
TRIM41Q8WV44 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
TRIM41Q8WV44 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
TRIM41Q8WV44 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
TRIM41Q8WV44 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
TRIM41Q8WV44 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
TRIM41Q8WV44 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
TRIM41Q8WV44 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
TRIM41Q8WV44 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
TRIM41Q8WV44 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
TRIM41Q8WV44 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
TRIM41Q8WV44 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
TRIM41Q8WV44 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
TRIM41Q8WV44 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
TRIM41Q8WV44 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
TRIM41Q8WV44 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
TRIM41Q8WV44 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
TRIM41Q8WV44 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
TRIM41Q8WV44 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
TRIM41Q8WV44 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
TRIM41Q8WV44 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
TRIM41Q8WV44 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
TRIM41Q8WV44 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
TRIM41Q8WV44 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
TRIM41Q8WV44 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
TRIM41Q8WV44 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
TRIM41Q8WV44 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.15
TRIM41Q8WV44 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC41■■■■■ 4.15
TRIM41Q8WV44 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
TRIM41Q8WV44 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
TRIM41Q8WV44 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
TRIM41Q8WV44 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC40.99■■■■■ 4.15
TRIM41Q8WV44 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
TRIM41Q8WV44 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
TRIM41Q8WV44 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
TRIM41Q8WV44 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
TRIM41Q8WV44 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
TRIM41Q8WV44 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
TRIM41Q8WV44 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms