Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SFT2D1Q8WV19 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFT2D1Q8WV19 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.7 ms