Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBN0

RAB3IL1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IL1Q8TBN0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB3IL1Q8TBN0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3IL1Q8TBN0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms