Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATAD1Q8NBU5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATAD1Q8NBU5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATAD1Q8NBU5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATAD1Q8NBU5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATAD1Q8NBU5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ATAD1Q8NBU5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATAD1Q8NBU5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATAD1Q8NBU5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATAD1Q8NBU5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATAD1Q8NBU5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATAD1Q8NBU5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATAD1Q8NBU5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATAD1Q8NBU5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATAD1Q8NBU5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATAD1Q8NBU5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATAD1Q8NBU5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATAD1Q8NBU5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATAD1Q8NBU5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATAD1Q8NBU5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ATAD1Q8NBU5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATAD1Q8NBU5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATAD1Q8NBU5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATAD1Q8NBU5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATAD1Q8NBU5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATAD1Q8NBU5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATAD1Q8NBU5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATAD1Q8NBU5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATAD1Q8NBU5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ATAD1Q8NBU5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATAD1Q8NBU5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ATAD1Q8NBU5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATAD1Q8NBU5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATAD1Q8NBU5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATAD1Q8NBU5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATAD1Q8NBU5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATAD1Q8NBU5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATAD1Q8NBU5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATAD1Q8NBU5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATAD1Q8NBU5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATAD1Q8NBU5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATAD1Q8NBU5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ATAD1Q8NBU5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ATAD1Q8NBU5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATAD1Q8NBU5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATAD1Q8NBU5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATAD1Q8NBU5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATAD1Q8NBU5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATAD1Q8NBU5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATAD1Q8NBU5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ATAD1Q8NBU5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATAD1Q8NBU5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATAD1Q8NBU5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATAD1Q8NBU5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATAD1Q8NBU5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ATAD1Q8NBU5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATAD1Q8NBU5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 557.8 ms