Protein–RNA interactions for Protein: Q8N183

NDUFAF2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF2Q8N183 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDUFAF2Q8N183 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NDUFAF2Q8N183 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFAF2Q8N183 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFAF2Q8N183 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFAF2Q8N183 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFAF2Q8N183 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFAF2Q8N183 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFAF2Q8N183 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFAF2Q8N183 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFAF2Q8N183 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDUFAF2Q8N183 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDUFAF2Q8N183 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDUFAF2Q8N183 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NDUFAF2Q8N183 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDUFAF2Q8N183 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDUFAF2Q8N183 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDUFAF2Q8N183 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDUFAF2Q8N183 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDUFAF2Q8N183 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDUFAF2Q8N183 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NDUFAF2Q8N183 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDUFAF2Q8N183 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDUFAF2Q8N183 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDUFAF2Q8N183 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDUFAF2Q8N183 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDUFAF2Q8N183 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NDUFAF2Q8N183 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDUFAF2Q8N183 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDUFAF2Q8N183 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDUFAF2Q8N183 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDUFAF2Q8N183 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDUFAF2Q8N183 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDUFAF2Q8N183 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDUFAF2Q8N183 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDUFAF2Q8N183 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDUFAF2Q8N183 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDUFAF2Q8N183 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDUFAF2Q8N183 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDUFAF2Q8N183 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDUFAF2Q8N183 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDUFAF2Q8N183 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDUFAF2Q8N183 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDUFAF2Q8N183 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDUFAF2Q8N183 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDUFAF2Q8N183 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDUFAF2Q8N183 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDUFAF2Q8N183 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDUFAF2Q8N183 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDUFAF2Q8N183 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDUFAF2Q8N183 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NDUFAF2Q8N183 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NDUFAF2Q8N183 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDUFAF2Q8N183 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDUFAF2Q8N183 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDUFAF2Q8N183 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDUFAF2Q8N183 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDUFAF2Q8N183 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDUFAF2Q8N183 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDUFAF2Q8N183 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms