Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S1

DENND1B, DENN domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND1BQ6P3S1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DENND1BQ6P3S1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DENND1BQ6P3S1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DENND1BQ6P3S1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DENND1BQ6P3S1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DENND1BQ6P3S1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DENND1BQ6P3S1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DENND1BQ6P3S1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
DENND1BQ6P3S1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
DENND1BQ6P3S1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
DENND1BQ6P3S1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DENND1BQ6P3S1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DENND1BQ6P3S1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DENND1BQ6P3S1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DENND1BQ6P3S1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DENND1BQ6P3S1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DENND1BQ6P3S1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DENND1BQ6P3S1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DENND1BQ6P3S1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DENND1BQ6P3S1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DENND1BQ6P3S1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DENND1BQ6P3S1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DENND1BQ6P3S1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DENND1BQ6P3S1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DENND1BQ6P3S1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DENND1BQ6P3S1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DENND1BQ6P3S1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DENND1BQ6P3S1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DENND1BQ6P3S1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DENND1BQ6P3S1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DENND1BQ6P3S1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DENND1BQ6P3S1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DENND1BQ6P3S1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DENND1BQ6P3S1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DENND1BQ6P3S1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DENND1BQ6P3S1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DENND1BQ6P3S1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DENND1BQ6P3S1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DENND1BQ6P3S1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DENND1BQ6P3S1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DENND1BQ6P3S1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DENND1BQ6P3S1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DENND1BQ6P3S1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DENND1BQ6P3S1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DENND1BQ6P3S1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DENND1BQ6P3S1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DENND1BQ6P3S1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DENND1BQ6P3S1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DENND1BQ6P3S1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DENND1BQ6P3S1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DENND1BQ6P3S1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DENND1BQ6P3S1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DENND1BQ6P3S1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DENND1BQ6P3S1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DENND1BQ6P3S1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DENND1BQ6P3S1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DENND1BQ6P3S1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DENND1BQ6P3S1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DENND1BQ6P3S1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DENND1BQ6P3S1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DENND1BQ6P3S1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DENND1BQ6P3S1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DENND1BQ6P3S1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DENND1BQ6P3S1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DENND1BQ6P3S1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DENND1BQ6P3S1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DENND1BQ6P3S1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DENND1BQ6P3S1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DENND1BQ6P3S1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DENND1BQ6P3S1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DENND1BQ6P3S1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DENND1BQ6P3S1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DENND1BQ6P3S1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DENND1BQ6P3S1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DENND1BQ6P3S1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DENND1BQ6P3S1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DENND1BQ6P3S1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DENND1BQ6P3S1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DENND1BQ6P3S1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DENND1BQ6P3S1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DENND1BQ6P3S1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DENND1BQ6P3S1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DENND1BQ6P3S1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DENND1BQ6P3S1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DENND1BQ6P3S1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DENND1BQ6P3S1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DENND1BQ6P3S1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DENND1BQ6P3S1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DENND1BQ6P3S1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DENND1BQ6P3S1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms