Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC183Q5T5S1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC183Q5T5S1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC183Q5T5S1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC183Q5T5S1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC183Q5T5S1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC183Q5T5S1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC183Q5T5S1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC183Q5T5S1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC183Q5T5S1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC183Q5T5S1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC183Q5T5S1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC183Q5T5S1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC183Q5T5S1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC183Q5T5S1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC183Q5T5S1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC183Q5T5S1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC183Q5T5S1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC183Q5T5S1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC183Q5T5S1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC183Q5T5S1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC183Q5T5S1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC183Q5T5S1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC183Q5T5S1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC183Q5T5S1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC183Q5T5S1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC183Q5T5S1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC183Q5T5S1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC183Q5T5S1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 430.9 ms