Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGAP29Q52LW3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGAP29Q52LW3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGAP29Q52LW3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGAP29Q52LW3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGAP29Q52LW3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGAP29Q52LW3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGAP29Q52LW3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGAP29Q52LW3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGAP29Q52LW3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGAP29Q52LW3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGAP29Q52LW3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGAP29Q52LW3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGAP29Q52LW3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGAP29Q52LW3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGAP29Q52LW3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGAP29Q52LW3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGAP29Q52LW3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGAP29Q52LW3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGAP29Q52LW3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGAP29Q52LW3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGAP29Q52LW3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGAP29Q52LW3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARHGAP29Q52LW3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARHGAP29Q52LW3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARHGAP29Q52LW3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ARHGAP29Q52LW3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARHGAP29Q52LW3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARHGAP29Q52LW3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGAP29Q52LW3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGAP29Q52LW3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGAP29Q52LW3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGAP29Q52LW3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGAP29Q52LW3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGAP29Q52LW3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGAP29Q52LW3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARHGAP29Q52LW3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARHGAP29Q52LW3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ARHGAP29Q52LW3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARHGAP29Q52LW3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ARHGAP29Q52LW3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ARHGAP29Q52LW3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ARHGAP29Q52LW3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARHGAP29Q52LW3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARHGAP29Q52LW3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARHGAP29Q52LW3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARHGAP29Q52LW3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARHGAP29Q52LW3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARHGAP29Q52LW3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARHGAP29Q52LW3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARHGAP29Q52LW3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARHGAP29Q52LW3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARHGAP29Q52LW3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARHGAP29Q52LW3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARHGAP29Q52LW3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARHGAP29Q52LW3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARHGAP29Q52LW3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARHGAP29Q52LW3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARHGAP29Q52LW3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARHGAP29Q52LW3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARHGAP29Q52LW3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARHGAP29Q52LW3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARHGAP29Q52LW3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARHGAP29Q52LW3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARHGAP29Q52LW3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARHGAP29Q52LW3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARHGAP29Q52LW3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARHGAP29Q52LW3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARHGAP29Q52LW3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARHGAP29Q52LW3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARHGAP29Q52LW3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARHGAP29Q52LW3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARHGAP29Q52LW3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ARHGAP29Q52LW3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms