Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKN3Q16667 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKN3Q16667 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKN3Q16667 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKN3Q16667 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDKN3Q16667 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDKN3Q16667 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CDKN3Q16667 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDKN3Q16667 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDKN3Q16667 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDKN3Q16667 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDKN3Q16667 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDKN3Q16667 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDKN3Q16667 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDKN3Q16667 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDKN3Q16667 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDKN3Q16667 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDKN3Q16667 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDKN3Q16667 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDKN3Q16667 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDKN3Q16667 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDKN3Q16667 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDKN3Q16667 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDKN3Q16667 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKN3Q16667 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKN3Q16667 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKN3Q16667 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDKN3Q16667 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDKN3Q16667 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDKN3Q16667 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDKN3Q16667 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CDKN3Q16667 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDKN3Q16667 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDKN3Q16667 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKN3Q16667 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKN3Q16667 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKN3Q16667 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKN3Q16667 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKN3Q16667 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKN3Q16667 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKN3Q16667 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKN3Q16667 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKN3Q16667 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKN3Q16667 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKN3Q16667 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKN3Q16667 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKN3Q16667 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKN3Q16667 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKN3Q16667 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKN3Q16667 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKN3Q16667 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKN3Q16667 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKN3Q16667 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKN3Q16667 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDKN3Q16667 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDKN3Q16667 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDKN3Q16667 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDKN3Q16667 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKN3Q16667 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKN3Q16667 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKN3Q16667 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKN3Q16667 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKN3Q16667 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKN3Q16667 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKN3Q16667 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDKN3Q16667 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDKN3Q16667 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
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