Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EXT1Q16394 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXT1Q16394 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.5 ms