Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZIC1Q15915 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZIC1Q15915 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZIC1Q15915 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZIC1Q15915 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZIC1Q15915 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZIC1Q15915 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZIC1Q15915 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZIC1Q15915 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZIC1Q15915 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZIC1Q15915 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZIC1Q15915 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZIC1Q15915 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZIC1Q15915 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZIC1Q15915 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZIC1Q15915 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZIC1Q15915 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZIC1Q15915 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZIC1Q15915 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZIC1Q15915 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZIC1Q15915 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZIC1Q15915 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZIC1Q15915 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZIC1Q15915 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZIC1Q15915 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZIC1Q15915 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZIC1Q15915 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZIC1Q15915 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZIC1Q15915 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZIC1Q15915 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZIC1Q15915 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZIC1Q15915 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZIC1Q15915 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZIC1Q15915 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZIC1Q15915 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZIC1Q15915 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZIC1Q15915 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZIC1Q15915 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZIC1Q15915 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZIC1Q15915 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZIC1Q15915 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZIC1Q15915 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZIC1Q15915 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZIC1Q15915 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZIC1Q15915 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZIC1Q15915 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZIC1Q15915 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms