Protein–RNA interactions for Protein: Q14CW9

ATXN7L3, Ataxin-7-like protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L3Q14CW9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATXN7L3Q14CW9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATXN7L3Q14CW9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATXN7L3Q14CW9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATXN7L3Q14CW9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATXN7L3Q14CW9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATXN7L3Q14CW9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATXN7L3Q14CW9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATXN7L3Q14CW9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATXN7L3Q14CW9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATXN7L3Q14CW9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATXN7L3Q14CW9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATXN7L3Q14CW9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATXN7L3Q14CW9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATXN7L3Q14CW9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATXN7L3Q14CW9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATXN7L3Q14CW9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATXN7L3Q14CW9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATXN7L3Q14CW9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATXN7L3Q14CW9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATXN7L3Q14CW9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATXN7L3Q14CW9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATXN7L3Q14CW9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATXN7L3Q14CW9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATXN7L3Q14CW9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATXN7L3Q14CW9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATXN7L3Q14CW9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATXN7L3Q14CW9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATXN7L3Q14CW9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATXN7L3Q14CW9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATXN7L3Q14CW9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATXN7L3Q14CW9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATXN7L3Q14CW9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATXN7L3Q14CW9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATXN7L3Q14CW9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATXN7L3Q14CW9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATXN7L3Q14CW9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATXN7L3Q14CW9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATXN7L3Q14CW9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATXN7L3Q14CW9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATXN7L3Q14CW9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATXN7L3Q14CW9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.7 ms