Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUL4AQ13619 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUL4AQ13619 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUL4AQ13619 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUL4AQ13619 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUL4AQ13619 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUL4AQ13619 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUL4AQ13619 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CUL4AQ13619 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CUL4AQ13619 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CUL4AQ13619 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CUL4AQ13619 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CUL4AQ13619 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CUL4AQ13619 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CUL4AQ13619 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CUL4AQ13619 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CUL4AQ13619 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CUL4AQ13619 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CUL4AQ13619 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CUL4AQ13619 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CUL4AQ13619 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CUL4AQ13619 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CUL4AQ13619 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CUL4AQ13619 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CUL4AQ13619 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CUL4AQ13619 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CUL4AQ13619 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CUL4AQ13619 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CUL4AQ13619 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CUL4AQ13619 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CUL4AQ13619 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CUL4AQ13619 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CUL4AQ13619 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CUL4AQ13619 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CUL4AQ13619 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CUL4AQ13619 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CUL4AQ13619 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CUL4AQ13619 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CUL4AQ13619 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CUL4AQ13619 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CUL4AQ13619 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CUL4AQ13619 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CUL4AQ13619 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CUL4AQ13619 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CUL4AQ13619 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CUL4AQ13619 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CUL4AQ13619 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CUL4AQ13619 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CUL4AQ13619 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CUL4AQ13619 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CUL4AQ13619 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CUL4AQ13619 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CUL4AQ13619 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CUL4AQ13619 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CUL4AQ13619 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CUL4AQ13619 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CUL4AQ13619 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CUL4AQ13619 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CUL4AQ13619 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CUL4AQ13619 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CUL4AQ13619 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CUL4AQ13619 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUL4AQ13619 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUL4AQ13619 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUL4AQ13619 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUL4AQ13619 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CUL4AQ13619 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CUL4AQ13619 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CUL4AQ13619 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CUL4AQ13619 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CUL4AQ13619 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CUL4AQ13619 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CUL4AQ13619 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CUL4AQ13619 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CUL4AQ13619 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CUL4AQ13619 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CUL4AQ13619 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CUL4AQ13619 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CUL4AQ13619 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CUL4AQ13619 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CUL4AQ13619 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CUL4AQ13619 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CUL4AQ13619 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CUL4AQ13619 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CUL4AQ13619 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CUL4AQ13619 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CUL4AQ13619 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CUL4AQ13619 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CUL4AQ13619 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CUL4AQ13619 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CUL4AQ13619 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CUL4AQ13619 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CUL4AQ13619 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CUL4AQ13619 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CUL4AQ13619 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CUL4AQ13619 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CUL4AQ13619 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CUL4AQ13619 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CUL4AQ13619 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CUL4AQ13619 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
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