Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
APOBRQ0VD83 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
APOBRQ0VD83 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
APOBRQ0VD83 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
APOBRQ0VD83 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
APOBRQ0VD83 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
APOBRQ0VD83 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
APOBRQ0VD83 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
APOBRQ0VD83 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
APOBRQ0VD83 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
APOBRQ0VD83 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
APOBRQ0VD83 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
APOBRQ0VD83 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
APOBRQ0VD83 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
APOBRQ0VD83 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
APOBRQ0VD83 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
APOBRQ0VD83 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
APOBRQ0VD83 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
APOBRQ0VD83 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
APOBRQ0VD83 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
APOBRQ0VD83 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
APOBRQ0VD83 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
APOBRQ0VD83 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
APOBRQ0VD83 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
APOBRQ0VD83 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
APOBRQ0VD83 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
APOBRQ0VD83 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
APOBRQ0VD83 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
APOBRQ0VD83 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
APOBRQ0VD83 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
APOBRQ0VD83 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
APOBRQ0VD83 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
APOBRQ0VD83 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
APOBRQ0VD83 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
APOBRQ0VD83 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
APOBRQ0VD83 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
APOBRQ0VD83 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
APOBRQ0VD83 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
APOBRQ0VD83 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
APOBRQ0VD83 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
APOBRQ0VD83 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
APOBRQ0VD83 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
APOBRQ0VD83 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
APOBRQ0VD83 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
APOBRQ0VD83 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
APOBRQ0VD83 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
APOBRQ0VD83 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
APOBRQ0VD83 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
APOBRQ0VD83 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
APOBRQ0VD83 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
APOBRQ0VD83 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
APOBRQ0VD83 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
APOBRQ0VD83 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
APOBRQ0VD83 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
APOBRQ0VD83 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
APOBRQ0VD83 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
APOBRQ0VD83 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
APOBRQ0VD83 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
APOBRQ0VD83 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APOBRQ0VD83 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APOBRQ0VD83 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APOBRQ0VD83 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
APOBRQ0VD83 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
APOBRQ0VD83 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APOBRQ0VD83 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
APOBRQ0VD83 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
APOBRQ0VD83 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
APOBRQ0VD83 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
APOBRQ0VD83 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
APOBRQ0VD83 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
APOBRQ0VD83 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
APOBRQ0VD83 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
APOBRQ0VD83 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
APOBRQ0VD83 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
APOBRQ0VD83 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
APOBRQ0VD83 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
APOBRQ0VD83 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
APOBRQ0VD83 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
APOBRQ0VD83 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
APOBRQ0VD83 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
APOBRQ0VD83 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms