Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HBBP68871 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HBBP68871 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HBBP68871 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HBBP68871 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HBBP68871 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HBBP68871 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HBBP68871 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HBBP68871 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HBBP68871 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HBBP68871 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HBBP68871 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HBBP68871 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HBBP68871 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HBBP68871 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HBBP68871 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HBBP68871 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HBBP68871 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HBBP68871 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HBBP68871 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HBBP68871 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HBBP68871 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HBBP68871 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HBBP68871 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HBBP68871 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HBBP68871 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HBBP68871 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HBBP68871 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HBBP68871 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HBBP68871 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HBBP68871 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HBBP68871 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HBBP68871 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HBBP68871 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HBBP68871 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HBBP68871 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HBBP68871 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HBBP68871 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HBBP68871 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HBBP68871 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HBBP68871 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HBBP68871 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HBBP68871 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HBBP68871 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HBBP68871 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HBBP68871 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HBBP68871 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HBBP68871 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HBBP68871 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HBBP68871 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HBBP68871 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HBBP68871 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HBBP68871 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HBBP68871 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HBBP68871 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HBBP68871 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HBBP68871 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HBBP68871 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HBBP68871 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HBBP68871 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HBBP68871 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HBBP68871 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HBBP68871 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HBBP68871 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HBBP68871 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HBBP68871 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HBBP68871 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HBBP68871 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HBBP68871 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HBBP68871 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HBBP68871 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HBBP68871 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HBBP68871 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HBBP68871 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HBBP68871 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HBBP68871 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HBBP68871 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HBBP68871 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HBBP68871 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HBBP68871 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HBBP68871 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HBBP68871 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HBBP68871 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HBBP68871 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HBBP68871 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HBBP68871 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HBBP68871 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HBBP68871 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HBBP68871 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HBBP68871 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HBBP68871 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HBBP68871 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HBBP68871 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HBBP68871 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HBBP68871 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HBBP68871 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HBBP68871 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HBBP68871 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HBBP68871 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HBBP68871 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms