Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP1S1P61966 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP1S1P61966 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP1S1P61966 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP1S1P61966 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP1S1P61966 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP1S1P61966 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP1S1P61966 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP1S1P61966 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP1S1P61966 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP1S1P61966 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP1S1P61966 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP1S1P61966 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP1S1P61966 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP1S1P61966 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP1S1P61966 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP1S1P61966 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP1S1P61966 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP1S1P61966 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP1S1P61966 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
AP1S1P61966 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP1S1P61966 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP1S1P61966 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AP1S1P61966 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP1S1P61966 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP1S1P61966 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP1S1P61966 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP1S1P61966 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP1S1P61966 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP1S1P61966 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
AP1S1P61966 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP1S1P61966 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP1S1P61966 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP1S1P61966 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP1S1P61966 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP1S1P61966 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP1S1P61966 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP1S1P61966 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP1S1P61966 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
AP1S1P61966 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP1S1P61966 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP1S1P61966 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP1S1P61966 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP1S1P61966 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP1S1P61966 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP1S1P61966 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP1S1P61966 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP1S1P61966 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP1S1P61966 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP1S1P61966 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP1S1P61966 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP1S1P61966 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP1S1P61966 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP1S1P61966 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP1S1P61966 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP1S1P61966 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP1S1P61966 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP1S1P61966 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP1S1P61966 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP1S1P61966 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP1S1P61966 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP1S1P61966 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
AP1S1P61966 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
AP1S1P61966 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP1S1P61966 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP1S1P61966 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
AP1S1P61966 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP1S1P61966 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP1S1P61966 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP1S1P61966 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
AP1S1P61966 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP1S1P61966 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP1S1P61966 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP1S1P61966 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP1S1P61966 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP1S1P61966 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP1S1P61966 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP1S1P61966 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP1S1P61966 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP1S1P61966 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP1S1P61966 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP1S1P61966 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP1S1P61966 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP1S1P61966 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP1S1P61966 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP1S1P61966 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP1S1P61966 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP1S1P61966 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP1S1P61966 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
AP1S1P61966 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP1S1P61966 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP1S1P61966 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP1S1P61966 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP1S1P61966 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP1S1P61966 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP1S1P61966 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP1S1P61966 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP1S1P61966 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP1S1P61966 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP1S1P61966 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms