Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCBP4P57723 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCBP4P57723 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCBP4P57723 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCBP4P57723 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCBP4P57723 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCBP4P57723 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCBP4P57723 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCBP4P57723 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCBP4P57723 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCBP4P57723 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCBP4P57723 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCBP4P57723 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCBP4P57723 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCBP4P57723 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCBP4P57723 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCBP4P57723 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCBP4P57723 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PCBP4P57723 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCBP4P57723 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCBP4P57723 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCBP4P57723 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCBP4P57723 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PCBP4P57723 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCBP4P57723 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCBP4P57723 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCBP4P57723 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCBP4P57723 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCBP4P57723 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCBP4P57723 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCBP4P57723 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCBP4P57723 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCBP4P57723 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCBP4P57723 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCBP4P57723 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCBP4P57723 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCBP4P57723 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCBP4P57723 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCBP4P57723 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCBP4P57723 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCBP4P57723 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCBP4P57723 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCBP4P57723 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCBP4P57723 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCBP4P57723 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCBP4P57723 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCBP4P57723 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCBP4P57723 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCBP4P57723 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PCBP4P57723 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PCBP4P57723 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCBP4P57723 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCBP4P57723 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCBP4P57723 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCBP4P57723 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PCBP4P57723 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCBP4P57723 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCBP4P57723 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCBP4P57723 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCBP4P57723 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCBP4P57723 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCBP4P57723 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCBP4P57723 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCBP4P57723 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCBP4P57723 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCBP4P57723 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCBP4P57723 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCBP4P57723 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCBP4P57723 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCBP4P57723 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCBP4P57723 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCBP4P57723 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms