Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CLDN15P56746 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN15P56746 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN15P56746 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN15P56746 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN15P56746 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN15P56746 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN15P56746 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN15P56746 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN15P56746 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN15P56746 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN15P56746 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN15P56746 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN15P56746 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN15P56746 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN15P56746 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN15P56746 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN15P56746 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN15P56746 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN15P56746 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN15P56746 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN15P56746 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN15P56746 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN15P56746 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN15P56746 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN15P56746 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN15P56746 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN15P56746 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN15P56746 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN15P56746 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN15P56746 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN15P56746 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN15P56746 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN15P56746 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN15P56746 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN15P56746 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN15P56746 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN15P56746 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN15P56746 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN15P56746 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN15P56746 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN15P56746 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN15P56746 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLDN15P56746 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms