Protein–RNA interactions for Protein: P54219

SLC18A1, Chromaffin granule amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A1P54219 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC18A1P54219 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC18A1P54219 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC18A1P54219 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC18A1P54219 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC18A1P54219 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC18A1P54219 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC18A1P54219 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC18A1P54219 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC18A1P54219 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC18A1P54219 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC18A1P54219 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC18A1P54219 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC18A1P54219 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC18A1P54219 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1050 ms