Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSC2P49815 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSC2P49815 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSC2P49815 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSC2P49815 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSC2P49815 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSC2P49815 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSC2P49815 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TSC2P49815 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSC2P49815 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSC2P49815 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSC2P49815 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSC2P49815 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TSC2P49815 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSC2P49815 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSC2P49815 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSC2P49815 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSC2P49815 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSC2P49815 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSC2P49815 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSC2P49815 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSC2P49815 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSC2P49815 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSC2P49815 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSC2P49815 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSC2P49815 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSC2P49815 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSC2P49815 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSC2P49815 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSC2P49815 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSC2P49815 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSC2P49815 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSC2P49815 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSC2P49815 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSC2P49815 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSC2P49815 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSC2P49815 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSC2P49815 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSC2P49815 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSC2P49815 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSC2P49815 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TSC2P49815 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSC2P49815 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSC2P49815 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSC2P49815 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSC2P49815 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSC2P49815 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSC2P49815 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSC2P49815 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSC2P49815 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSC2P49815 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSC2P49815 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TSC2P49815 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TSC2P49815 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TSC2P49815 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSC2P49815 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TSC2P49815 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSC2P49815 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSC2P49815 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSC2P49815 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSC2P49815 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSC2P49815 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TSC2P49815 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSC2P49815 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TSC2P49815 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSC2P49815 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSC2P49815 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSC2P49815 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSC2P49815 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSC2P49815 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSC2P49815 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSC2P49815 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TSC2P49815 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSC2P49815 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSC2P49815 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSC2P49815 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSC2P49815 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSC2P49815 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSC2P49815 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSC2P49815 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSC2P49815 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSC2P49815 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSC2P49815 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSC2P49815 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSC2P49815 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSC2P49815 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSC2P49815 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSC2P49815 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TSC2P49815 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSC2P49815 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSC2P49815 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TSC2P49815 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSC2P49815 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSC2P49815 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSC2P49815 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSC2P49815 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSC2P49815 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSC2P49815 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSC2P49815 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSC2P49815 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms