Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP13P45452 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP13P45452 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP13P45452 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP13P45452 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP13P45452 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP13P45452 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP13P45452 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP13P45452 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP13P45452 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP13P45452 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP13P45452 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP13P45452 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP13P45452 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP13P45452 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP13P45452 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP13P45452 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP13P45452 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP13P45452 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP13P45452 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP13P45452 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP13P45452 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP13P45452 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP13P45452 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP13P45452 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP13P45452 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP13P45452 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP13P45452 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP13P45452 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP13P45452 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP13P45452 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP13P45452 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP13P45452 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP13P45452 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP13P45452 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP13P45452 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP13P45452 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP13P45452 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP13P45452 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP13P45452 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP13P45452 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP13P45452 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP13P45452 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP13P45452 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP13P45452 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP13P45452 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP13P45452 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP13P45452 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP13P45452 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP13P45452 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP13P45452 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MMP13P45452 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMP13P45452 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MMP13P45452 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMP13P45452 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMP13P45452 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMP13P45452 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMP13P45452 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMP13P45452 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMP13P45452 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMP13P45452 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMP13P45452 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMP13P45452 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMP13P45452 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMP13P45452 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP13P45452 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP13P45452 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP13P45452 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP13P45452 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP13P45452 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP13P45452 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP13P45452 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP13P45452 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMP13P45452 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMP13P45452 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMP13P45452 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMP13P45452 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMP13P45452 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP13P45452 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP13P45452 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP13P45452 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP13P45452 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP13P45452 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP13P45452 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP13P45452 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP13P45452 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP13P45452 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP13P45452 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMP13P45452 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMP13P45452 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMP13P45452 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMP13P45452 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMP13P45452 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMP13P45452 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMP13P45452 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMP13P45452 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMP13P45452 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MMP13P45452 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP13P45452 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP13P45452 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms