Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSFMP43897 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSFMP43897 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSFMP43897 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSFMP43897 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSFMP43897 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSFMP43897 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSFMP43897 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSFMP43897 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSFMP43897 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSFMP43897 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSFMP43897 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSFMP43897 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSFMP43897 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSFMP43897 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSFMP43897 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSFMP43897 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSFMP43897 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSFMP43897 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSFMP43897 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSFMP43897 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TSFMP43897 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSFMP43897 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSFMP43897 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSFMP43897 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSFMP43897 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TSFMP43897 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSFMP43897 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSFMP43897 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSFMP43897 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSFMP43897 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSFMP43897 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSFMP43897 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSFMP43897 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSFMP43897 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSFMP43897 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSFMP43897 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSFMP43897 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSFMP43897 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSFMP43897 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSFMP43897 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSFMP43897 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSFMP43897 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSFMP43897 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSFMP43897 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSFMP43897 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSFMP43897 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSFMP43897 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSFMP43897 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSFMP43897 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSFMP43897 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSFMP43897 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSFMP43897 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSFMP43897 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSFMP43897 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSFMP43897 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSFMP43897 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSFMP43897 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSFMP43897 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSFMP43897 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSFMP43897 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSFMP43897 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSFMP43897 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSFMP43897 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSFMP43897 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSFMP43897 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TSFMP43897 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSFMP43897 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSFMP43897 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSFMP43897 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSFMP43897 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSFMP43897 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSFMP43897 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSFMP43897 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TSFMP43897 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSFMP43897 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSFMP43897 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSFMP43897 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSFMP43897 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSFMP43897 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSFMP43897 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSFMP43897 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSFMP43897 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSFMP43897 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSFMP43897 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSFMP43897 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSFMP43897 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSFMP43897 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSFMP43897 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSFMP43897 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSFMP43897 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSFMP43897 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSFMP43897 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSFMP43897 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSFMP43897 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSFMP43897 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSFMP43897 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSFMP43897 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TSFMP43897 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TSFMP43897 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms