Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ARL3P36405 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ARL3P36405 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ARL3P36405 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ARL3P36405 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ARL3P36405 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ARL3P36405 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ARL3P36405 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ARL3P36405 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ARL3P36405 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ARL3P36405 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ARL3P36405 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ARL3P36405 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ARL3P36405 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ARL3P36405 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ARL3P36405 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ARL3P36405 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ARL3P36405 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ARL3P36405 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ARL3P36405 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ARL3P36405 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARL3P36405 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARL3P36405 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARL3P36405 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARL3P36405 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARL3P36405 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARL3P36405 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARL3P36405 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARL3P36405 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARL3P36405 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ARL3P36405 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARL3P36405 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ARL3P36405 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ARL3P36405 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARL3P36405 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARL3P36405 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARL3P36405 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARL3P36405 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARL3P36405 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARL3P36405 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARL3P36405 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARL3P36405 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARL3P36405 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARL3P36405 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARL3P36405 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL3P36405 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL3P36405 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL3P36405 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL3P36405 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL3P36405 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL3P36405 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL3P36405 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL3P36405 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL3P36405 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL3P36405 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL3P36405 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL3P36405 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL3P36405 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL3P36405 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL3P36405 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL3P36405 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL3P36405 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL3P36405 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARL3P36405 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARL3P36405 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARL3P36405 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARL3P36405 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARL3P36405 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARL3P36405 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARL3P36405 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARL3P36405 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARL3P36405 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARL3P36405 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARL3P36405 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARL3P36405 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARL3P36405 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARL3P36405 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARL3P36405 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ARL3P36405 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARL3P36405 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARL3P36405 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARL3P36405 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARL3P36405 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
ARL3P36405 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARL3P36405 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARL3P36405 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARL3P36405 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARL3P36405 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARL3P36405 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARL3P36405 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARL3P36405 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARL3P36405 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARL3P36405 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARL3P36405 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARL3P36405 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ARL3P36405 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ARL3P36405 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ARL3P36405 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ARL3P36405 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ARL3P36405 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms