Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCD1P33897 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCD1P33897 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCD1P33897 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCD1P33897 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCD1P33897 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCD1P33897 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCD1P33897 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCD1P33897 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCD1P33897 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCD1P33897 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCD1P33897 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCD1P33897 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCD1P33897 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCD1P33897 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCD1P33897 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCD1P33897 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCD1P33897 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCD1P33897 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCD1P33897 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCD1P33897 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCD1P33897 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCD1P33897 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCD1P33897 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCD1P33897 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCD1P33897 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCD1P33897 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCD1P33897 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCD1P33897 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCD1P33897 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCD1P33897 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCD1P33897 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCD1P33897 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCD1P33897 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCD1P33897 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCD1P33897 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCD1P33897 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCD1P33897 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCD1P33897 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCD1P33897 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCD1P33897 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCD1P33897 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCD1P33897 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCD1P33897 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCD1P33897 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCD1P33897 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCD1P33897 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCD1P33897 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCD1P33897 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCD1P33897 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCD1P33897 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCD1P33897 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms