Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GBP2P32456 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GBP2P32456 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GBP2P32456 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GBP2P32456 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GBP2P32456 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GBP2P32456 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GBP2P32456 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GBP2P32456 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GBP2P32456 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GBP2P32456 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GBP2P32456 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GBP2P32456 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GBP2P32456 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GBP2P32456 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GBP2P32456 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GBP2P32456 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GBP2P32456 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GBP2P32456 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GBP2P32456 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GBP2P32456 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GBP2P32456 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GBP2P32456 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GBP2P32456 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GBP2P32456 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GBP2P32456 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GBP2P32456 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GBP2P32456 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GBP2P32456 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GBP2P32456 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GBP2P32456 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GBP2P32456 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GBP2P32456 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GBP2P32456 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GBP2P32456 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GBP2P32456 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GBP2P32456 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GBP2P32456 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GBP2P32456 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GBP2P32456 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GBP2P32456 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GBP2P32456 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GBP2P32456 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GBP2P32456 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GBP2P32456 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GBP2P32456 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GBP2P32456 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GBP2P32456 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GBP2P32456 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GBP2P32456 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GBP2P32456 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GBP2P32456 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GBP2P32456 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GBP2P32456 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GBP2P32456 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GBP2P32456 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GBP2P32456 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GBP2P32456 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GBP2P32456 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GBP2P32456 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GBP2P32456 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GBP2P32456 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GBP2P32456 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GBP2P32456 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GBP2P32456 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GBP2P32456 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GBP2P32456 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GBP2P32456 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GBP2P32456 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GBP2P32456 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GBP2P32456 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GBP2P32456 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GBP2P32456 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GBP2P32456 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GBP2P32456 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GBP2P32456 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GBP2P32456 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GBP2P32456 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GBP2P32456 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GBP2P32456 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GBP2P32456 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GBP2P32456 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GBP2P32456 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GBP2P32456 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GBP2P32456 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GBP2P32456 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GBP2P32456 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GBP2P32456 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GBP2P32456 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GBP2P32456 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GBP2P32456 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBP2P32456 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBP2P32456 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBP2P32456 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBP2P32456 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GBP2P32456 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GBP2P32456 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GBP2P32456 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GBP2P32456 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GBP2P32456 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms