Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCR1P32246 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCR1P32246 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCR1P32246 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCR1P32246 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCR1P32246 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCR1P32246 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCR1P32246 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCR1P32246 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCR1P32246 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCR1P32246 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCR1P32246 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCR1P32246 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCR1P32246 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCR1P32246 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCR1P32246 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCR1P32246 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCR1P32246 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCR1P32246 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCR1P32246 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCR1P32246 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCR1P32246 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCR1P32246 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCR1P32246 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCR1P32246 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCR1P32246 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCR1P32246 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCR1P32246 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCR1P32246 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCR1P32246 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCR1P32246 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCR1P32246 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCR1P32246 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCR1P32246 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCR1P32246 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCR1P32246 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCR1P32246 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCR1P32246 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCR1P32246 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCR1P32246 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCR1P32246 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCR1P32246 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCR1P32246 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCR1P32246 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCR1P32246 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCR1P32246 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCR1P32246 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCR1P32246 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCR1P32246 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCR1P32246 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCR1P32246 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCR1P32246 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCR1P32246 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCR1P32246 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCR1P32246 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCR1P32246 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCR1P32246 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCR1P32246 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCR1P32246 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR1P32246 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR1P32246 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR1P32246 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR1P32246 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR1P32246 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR1P32246 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR1P32246 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR1P32246 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR1P32246 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR1P32246 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCR1P32246 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCR1P32246 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCR1P32246 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCR1P32246 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCR1P32246 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCR1P32246 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCR1P32246 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCR1P32246 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCR1P32246 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCR1P32246 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCR1P32246 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCR1P32246 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCR1P32246 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCR1P32246 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCR1P32246 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCR1P32246 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCR1P32246 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCR1P32246 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCR1P32246 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCR1P32246 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCR1P32246 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCR1P32246 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCR1P32246 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCR1P32246 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCR1P32246 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCR1P32246 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCR1P32246 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCR1P32246 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCR1P32246 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCR1P32246 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCR1P32246 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms