Protein–RNA interactions for Protein: P23458

JAK1, Tyrosine-protein kinase JAK1, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAK1P23458 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
JAK1P23458 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
JAK1P23458 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
JAK1P23458 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
JAK1P23458 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
JAK1P23458 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
JAK1P23458 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
JAK1P23458 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
JAK1P23458 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
JAK1P23458 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
JAK1P23458 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
JAK1P23458 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
JAK1P23458 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
JAK1P23458 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
JAK1P23458 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
JAK1P23458 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
JAK1P23458 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
JAK1P23458 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
JAK1P23458 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
JAK1P23458 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
JAK1P23458 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
JAK1P23458 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
JAK1P23458 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
JAK1P23458 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
JAK1P23458 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
JAK1P23458 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
JAK1P23458 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
JAK1P23458 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
JAK1P23458 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
JAK1P23458 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
JAK1P23458 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
JAK1P23458 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
JAK1P23458 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
JAK1P23458 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
JAK1P23458 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
JAK1P23458 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
JAK1P23458 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
JAK1P23458 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
JAK1P23458 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
JAK1P23458 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
JAK1P23458 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
JAK1P23458 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
JAK1P23458 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
JAK1P23458 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
JAK1P23458 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
JAK1P23458 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
JAK1P23458 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
JAK1P23458 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
JAK1P23458 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
JAK1P23458 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
JAK1P23458 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
JAK1P23458 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
JAK1P23458 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
JAK1P23458 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
JAK1P23458 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
JAK1P23458 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
JAK1P23458 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
JAK1P23458 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
JAK1P23458 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
JAK1P23458 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
JAK1P23458 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
JAK1P23458 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
JAK1P23458 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
JAK1P23458 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
JAK1P23458 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
JAK1P23458 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
JAK1P23458 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
JAK1P23458 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
JAK1P23458 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
JAK1P23458 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
JAK1P23458 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
JAK1P23458 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
JAK1P23458 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
JAK1P23458 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
JAK1P23458 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
JAK1P23458 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
JAK1P23458 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
JAK1P23458 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
JAK1P23458 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
JAK1P23458 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
JAK1P23458 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
JAK1P23458 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
JAK1P23458 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
JAK1P23458 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
JAK1P23458 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
JAK1P23458 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
JAK1P23458 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
JAK1P23458 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
JAK1P23458 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
JAK1P23458 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
JAK1P23458 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
JAK1P23458 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
JAK1P23458 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
JAK1P23458 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
JAK1P23458 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
JAK1P23458 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
JAK1P23458 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
JAK1P23458 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
JAK1P23458 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
JAK1P23458 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.5 ms