Protein–RNA interactions for Protein: P17658

KCNA6, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 6, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA6P17658 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KCNA6P17658 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KCNA6P17658 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KCNA6P17658 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KCNA6P17658 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KCNA6P17658 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KCNA6P17658 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KCNA6P17658 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KCNA6P17658 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KCNA6P17658 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KCNA6P17658 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
KCNA6P17658 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
KCNA6P17658 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
KCNA6P17658 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
KCNA6P17658 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
KCNA6P17658 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
KCNA6P17658 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
KCNA6P17658 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
KCNA6P17658 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
KCNA6P17658 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
KCNA6P17658 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
KCNA6P17658 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
KCNA6P17658 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
KCNA6P17658 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
KCNA6P17658 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KCNA6P17658 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KCNA6P17658 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KCNA6P17658 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
KCNA6P17658 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KCNA6P17658 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KCNA6P17658 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
KCNA6P17658 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
KCNA6P17658 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
KCNA6P17658 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
KCNA6P17658 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
KCNA6P17658 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
KCNA6P17658 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
KCNA6P17658 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
KCNA6P17658 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
KCNA6P17658 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KCNA6P17658 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
KCNA6P17658 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
KCNA6P17658 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
KCNA6P17658 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KCNA6P17658 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KCNA6P17658 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KCNA6P17658 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KCNA6P17658 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KCNA6P17658 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
KCNA6P17658 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
KCNA6P17658 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
KCNA6P17658 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
KCNA6P17658 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
KCNA6P17658 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
KCNA6P17658 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
KCNA6P17658 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
KCNA6P17658 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
KCNA6P17658 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
KCNA6P17658 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
KCNA6P17658 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
KCNA6P17658 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
KCNA6P17658 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
KCNA6P17658 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
KCNA6P17658 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KCNA6P17658 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
KCNA6P17658 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
KCNA6P17658 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
KCNA6P17658 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KCNA6P17658 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KCNA6P17658 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
KCNA6P17658 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KCNA6P17658 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
KCNA6P17658 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
KCNA6P17658 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
KCNA6P17658 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KCNA6P17658 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KCNA6P17658 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
KCNA6P17658 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
KCNA6P17658 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
KCNA6P17658 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
KCNA6P17658 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
KCNA6P17658 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
KCNA6P17658 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
KCNA6P17658 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
KCNA6P17658 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
KCNA6P17658 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
KCNA6P17658 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
KCNA6P17658 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KCNA6P17658 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
KCNA6P17658 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KCNA6P17658 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KCNA6P17658 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KCNA6P17658 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KCNA6P17658 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KCNA6P17658 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KCNA6P17658 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KCNA6P17658 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KCNA6P17658 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KCNA6P17658 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KCNA6P17658 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms