Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HOXB8P17481 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXB8P17481 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXB8P17481 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXB8P17481 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXB8P17481 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXB8P17481 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXB8P17481 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXB8P17481 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXB8P17481 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXB8P17481 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXB8P17481 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXB8P17481 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXB8P17481 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXB8P17481 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXB8P17481 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXB8P17481 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXB8P17481 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXB8P17481 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXB8P17481 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXB8P17481 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXB8P17481 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXB8P17481 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXB8P17481 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXB8P17481 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXB8P17481 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXB8P17481 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXB8P17481 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXB8P17481 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXB8P17481 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXB8P17481 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXB8P17481 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXB8P17481 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.64
HOXB8P17481 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXB8P17481 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms