Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GATA1P15976 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GATA1P15976 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GATA1P15976 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GATA1P15976 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GATA1P15976 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GATA1P15976 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATA1P15976 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATA1P15976 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATA1P15976 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATA1P15976 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATA1P15976 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GATA1P15976 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GATA1P15976 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATA1P15976 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATA1P15976 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATA1P15976 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATA1P15976 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATA1P15976 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATA1P15976 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATA1P15976 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATA1P15976 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATA1P15976 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATA1P15976 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATA1P15976 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATA1P15976 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GATA1P15976 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GATA1P15976 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GATA1P15976 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GATA1P15976 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GATA1P15976 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GATA1P15976 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GATA1P15976 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GATA1P15976 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GATA1P15976 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GATA1P15976 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GATA1P15976 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GATA1P15976 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GATA1P15976 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GATA1P15976 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GATA1P15976 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GATA1P15976 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GATA1P15976 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GATA1P15976 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GATA1P15976 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GATA1P15976 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GATA1P15976 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GATA1P15976 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GATA1P15976 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GATA1P15976 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GATA1P15976 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
GATA1P15976 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GATA1P15976 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GATA1P15976 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GATA1P15976 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GATA1P15976 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GATA1P15976 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GATA1P15976 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GATA1P15976 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GATA1P15976 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GATA1P15976 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GATA1P15976 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA1P15976 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA1P15976 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA1P15976 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA1P15976 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA1P15976 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA1P15976 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA1P15976 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA1P15976 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA1P15976 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA1P15976 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA1P15976 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA1P15976 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA1P15976 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA1P15976 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA1P15976 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA1P15976 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA1P15976 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATA1P15976 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATA1P15976 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATA1P15976 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATA1P15976 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATA1P15976 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATA1P15976 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATA1P15976 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATA1P15976 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATA1P15976 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATA1P15976 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATA1P15976 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATA1P15976 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATA1P15976 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATA1P15976 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GATA1P15976 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATA1P15976 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATA1P15976 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATA1P15976 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GATA1P15976 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATA1P15976 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATA1P15976 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms