Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms