Protein–RNA interactions for Protein: P0DP25

CALM3, Calmodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM3P0DP25 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CALM3P0DP25 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CALM3P0DP25 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CALM3P0DP25 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CALM3P0DP25 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CALM3P0DP25 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CALM3P0DP25 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CALM3P0DP25 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CALM3P0DP25 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CALM3P0DP25 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CALM3P0DP25 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CALM3P0DP25 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CALM3P0DP25 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CALM3P0DP25 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CALM3P0DP25 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CALM3P0DP25 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CALM3P0DP25 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CALM3P0DP25 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CALM3P0DP25 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CALM3P0DP25 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CALM3P0DP25 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CALM3P0DP25 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CALM3P0DP25 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CALM3P0DP25 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CALM3P0DP25 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CALM3P0DP25 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CALM3P0DP25 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CALM3P0DP25 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CALM3P0DP25 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CALM3P0DP25 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CALM3P0DP25 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CALM3P0DP25 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CALM3P0DP25 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CALM3P0DP25 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CALM3P0DP25 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CALM3P0DP25 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CALM3P0DP25 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CALM3P0DP25 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CALM3P0DP25 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CALM3P0DP25 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CALM3P0DP25 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CALM3P0DP25 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CALM3P0DP25 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CALM3P0DP25 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CALM3P0DP25 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CALM3P0DP25 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CALM3P0DP25 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CALM3P0DP25 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CALM3P0DP25 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CALM3P0DP25 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CALM3P0DP25 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CALM3P0DP25 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CALM3P0DP25 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CALM3P0DP25 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CALM3P0DP25 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CALM3P0DP25 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CALM3P0DP25 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CALM3P0DP25 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CALM3P0DP25 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CALM3P0DP25 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CALM3P0DP25 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CALM3P0DP25 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CALM3P0DP25 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CALM3P0DP25 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CALM3P0DP25 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CALM3P0DP25 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CALM3P0DP25 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CALM3P0DP25 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CALM3P0DP25 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CALM3P0DP25 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CALM3P0DP25 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CALM3P0DP25 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CALM3P0DP25 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CALM3P0DP25 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CALM3P0DP25 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CALM3P0DP25 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CALM3P0DP25 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CALM3P0DP25 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CALM3P0DP25 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CALM3P0DP25 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CALM3P0DP25 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CALM3P0DP25 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CALM3P0DP25 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CALM3P0DP25 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CALM3P0DP25 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CALM3P0DP25 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CALM3P0DP25 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CALM3P0DP25 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CALM3P0DP25 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CALM3P0DP25 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CALM3P0DP25 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CALM3P0DP25 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CALM3P0DP25 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CALM3P0DP25 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CALM3P0DP25 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CALM3P0DP25 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CALM3P0DP25 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CALM3P0DP25 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CALM3P0DP25 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CALM3P0DP25 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms