Protein–RNA interactions for Protein: O75783

RHBDL1, Rhomboid-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL1O75783 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDL1O75783 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDL1O75783 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDL1O75783 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDL1O75783 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDL1O75783 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDL1O75783 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDL1O75783 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDL1O75783 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDL1O75783 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDL1O75783 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDL1O75783 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDL1O75783 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDL1O75783 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDL1O75783 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDL1O75783 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDL1O75783 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDL1O75783 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDL1O75783 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDL1O75783 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDL1O75783 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RHBDL1O75783 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHBDL1O75783 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHBDL1O75783 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHBDL1O75783 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHBDL1O75783 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHBDL1O75783 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHBDL1O75783 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHBDL1O75783 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHBDL1O75783 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RHBDL1O75783 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHBDL1O75783 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHBDL1O75783 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHBDL1O75783 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDL1O75783 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDL1O75783 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDL1O75783 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDL1O75783 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms